Cross-genera amplification and identification of Colpodella sp. with Cryptosporidium primers in fecal samples of zoo felids from northeast China / Amplificação cruzada de gêneros e identificação de Colpodella sp. com iniciadores de Cryptosporidium em amostras fecais de zoofilia do nordeste da China

Abstract The protozoans include many intracellular human pathogens. Accurate detection of these pathogens is necessary to treat the diseases. In clinical epidemiology, molecular identification of protozoan is considered a more reliable and rapid method for identification than microscopy. Among these protozoans, Cryptosporidium considered being one of the important water-borne zoonotic pathogens and a major cause of a diarrheal disease named cryptosporidiosis in humans, domestic animals, and wild animals. This study was aimed to identify Cryptosporidium in zoo felids (N= 56) belonging to different zoo of China, but accidentlly Colpodella was encountered in the zoo felids sample and phylogenetic data confirmed this unexpected amplification from fecal samples using two-step nested-PCR. Phylogenetic analysis revealed the fact about the specific primers used previously by many researchers and cross-genera amplification. We came to know that genetically sequenced amplicon gives more accurate identification of species. This study suggests more investigation on Colpodella which has been neglected previously but gains the attention of researchers after identified from humans and animals and has been known to correlate with neurological symptoms in patients.

Resumo Os protozoários incluem muitos patógenos humanos intracelulares. A detecção acurada desses patógenos é necessária para tratar as doenças. Na epidemiologia clínica, a identificação molecular de protozoários é considerada o método de identificação mais confiável e rápido do que a microscopia. Entre esses protozoários, o Cryptosporidium é considerado um dos importantes patógenos zoonóticos transmitidos pela água e uma das principais causas de uma doença diarreica denominada criptosporidiose em humanos, animais domésticos e selvagens. Este estudo teve como objetivo identificar Cryptosporidium em zoofelídeos (N = 56) pertencentes a diferentes zoológicos da China, mas acidentalmente Colpodella foi encontrada na amostra de zoofelídeos e os dados filogenéticos confirmaram essa amplificação inesperada de amostras fecais usando nested-PCR em duas etapas. A análise filogenética revelou o fato sobre os primers específicos usados ​​anteriormente por muitos pesquisadores e a amplificação entre gêneros. Ficamos sabendo que o amplicon sequenciado geneticamente fornece uma identificação mais acurada das espécies. Este estudo sugere mais investigação sobre Colpodella, que foi negligenciada anteriormente, mas ganha a atenção dos pesquisadores depois de identificada em humanos e animais e é conhecida por se correlacionar com sintomas neurológicos em pacientes.

Variations in nutritional profile of honey produced by various species of genus Apis / Variações no perfil nutricional do mel produzido por várias espécies do gênero Apis

Abstract The medicinal attributes of honey appears to overshadow its importance as a functional food. Consequently, several literatures are rife with ancient uses of honey as complementary and alternative medicine, with relevance to modern day health care, supported by evidence-based clinical data, with little attention given to honey's nutritional functions. The moisture contents of honey extracted from University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore honey bee farm was 12.19% while that of natural source was 9.03 ± 1.63%. Similarly, ash and protein contents of farmed honey recorded were 0.37% and 5.22%, respectively. Whereas ash and protein contents of natural honey were 1.70 ± 1.98% and 6.10 ± 0.79%. Likewise fat, dietary fiber and carbohydrates contents of farmed source documented were 0.14%, 1.99% and 62.26% respectively. Although fat, dietary fiber and carbohydrates contents of honey taken from natural resource were 0.54 ± 0.28%, 2.76 ± 1.07% and 55.32 ± 2.91% respectively. Glucose and fructose contents of honey taken out from honeybee farm were 27% and 34% but natural source were 22.50 ± 2.12% and 28.50 ± 3.54%. Glucose and fructose contents of honey taken out from honeybee farm were 27% and 34% but natural source were 22.50 ± 2.12% and 28.50 ± 3.54%. Similarly, sucrose and maltose contents of farmed honey were 2.5% and 12% while in natural honey were 1.35 ± 0.49% and 8.00 ± 1.41% respectively. The present study indicates that such as moisture, carbohydrates, sucrose and maltose contents were higher farmed honey as compared to the natural honey. In our recommendation natural honey is better than farmed honey.

Resumo Os atributos medicinais do mel parecem ofuscar sua importância como alimento funcional. Consequentemente, várias literaturas estão repletas de usos antigos do mel como medicina complementar e alternativa, com relevância para os cuidados de saúde modernos, apoiados por dados clínicos baseados em evidências, com pouca atenção dada às funções nutricionais do mel. O teor de umidade do mel extraído da Universidade de Veterinária e Ciências Animais, fazenda de abelhas de Lahore, foi de 12,19%, enquanto o de fonte natural foi de 9,03 ± 1,63%. Da mesma forma, os teores de cinzas e proteínas do mel cultivado foram de 0,37% e 5,22%, respectivamente. Já os teores de cinzas e proteínas do mel natural foram de 1,70 ± 1,98% e 6,10 ± 0,79%. Da mesma forma, os teores de gordura, fibra dietética e carboidratos de origem cultivada documentados foram de 0,14%, 1,99% e 62,26%, respectivamente. Embora os teores de gordura, fibra alimentar e carboidratos do mel retirado dos recursos naturais fossem de 0,54 ± 0,28%, 2,76 ± 1,07% e 55,32 ± 2,91%, respectivamente. Os conteúdos de glicose e frutose do mel retirado da fazenda de abelhas foram de 27% e 34%, mas a fonte natural foi de 22,50 ± 2,12% e 28,50 ± 3,54%. Os conteúdos de glicose e frutose do mel retirado da fazenda de abelhas foram de 27% e 34%, mas a fonte natural foi de 22,50 ± 2,12% e 28,50 ± 3,54%. Da mesma forma, os teores de sacarose e maltose no mel cultivado foram de 2,5% e 12%, enquanto no mel natural foram de 1,35 ± 0,49% e 8,00 ± 1,41%, respectivamente. O presente estudo indica que os teores de umidade, carboidratos, sacarose e maltose foram maiores no mel cultivado em comparação ao mel natural. Em nossa recomendação, o mel natural é melhor que o mel de cultivo.

Variations in nutritional profile of honey produced by various species of genus Apis / Variações no perfil nutricional do mel produzido por várias espécies do gênero Apis

The medicinal attributes of honey appears to overshadow its importance as a functional food. Consequently, several literatures are rife with ancient uses of honey as complementary and alternative medicine, with relevance to modern day health care, supported by evidence-based clinical data, with little attention given to honey’s nutritional functions. The moisture contents of honey extracted from University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore honey bee farm was 12.19% while that of natural source was 9.03 ± 1.63%. Similarly, ash and protein contents of farmed honey recorded were 0.37% and 5.22%, respectively. Whereas ash and protein contents of natural honey were 1.70 ± 1.98% and 6.10 ± 0.79%. Likewise fat, dietary fiber and carbohydrates contents of farmed source documented were 0.14%, 1.99% and 62.26% respectively. Although fat, dietary fiber and carbohydrates contents of honey taken from natural resource were 0.54 ± 0.28%, 2.76 ± 1.07% and 55.32 ± 2.91% respectively. Glucose and fructose contents of honey taken out from honeybee farm were 27% and 34% but natural source were 22.50 ± 2.12% and 28.50 ± 3.54%. Glucose and fructose contents of honey taken out from honeybee farm were 27% and 34% but natural source were 22.50 ± 2.12% and 28.50 ± 3.54%. Similarly, sucrose and maltose contents of farmed honey were 2.5% and 12% while in natural honey were 1.35 ± 0.49% and 8.00 ± 1.41% respectively. The present study indicates that such as moisture, carbohydrates, sucrose and maltose contents were higher farmed honey as compared to the natural honey. In our recommendation natural honey is better than farmed honey.

Os atributos medicinais do mel parecem ofuscar sua importância como alimento funcional. Consequentemente, várias literaturas estão repletas de usos antigos do mel como medicina complementar e alternativa, com relevância para os cuidados de saúde modernos, apoiados por dados clínicos baseados em evidências, com pouca atenção dada às funções nutricionais do mel. O teor de umidade do mel extraído da Universidade de Veterinária e Ciências Animais, fazenda de abelhas de Lahore, foi de 12,19%, enquanto o de fonte natural foi de 9,03 ± 1,63%. Da mesma forma, os teores de cinzas e proteínas do mel cultivado foram de 0,37% e 5,22%, respectivamente. Já os teores de cinzas e proteínas do mel natural foram de 1,70 ± 1,98% e 6,10 ± 0,79%. Da mesma forma, os teores de gordura, fibra dietética e carboidratos de origem cultivada documentados foram de 0,14%, 1,99% e 62,26%, respectivamente. Embora os teores de gordura, fibra alimentar e carboidratos do mel retirado dos recursos naturais fossem de 0,54 ± 0,28%, 2,76 ± 1,07% e 55,32 ± 2,91%, respectivamente. Os conteúdos de glicose e frutose do mel retirado da fazenda de abelhas foram de 27% e 34%, mas a fonte natural foi de 22,50 ± 2,12% e 28,50 ± 3,54%. Os conteúdos de glicose e frutose do mel retirado da fazenda de abelhas foram de 27% e 34%, mas a fonte natural foi de 22,50 ± 2,12% e 28,50 ± 3,54%. Da mesma forma, os teores de sacarose e maltose no mel cultivado foram de 2,5% e 12%, enquanto no mel natural foram de 1,35 ± 0,49% e 8,00 ± 1,41%, respectivamente. O presente estudo indica que os teores de umidade, carboidratos, sacarose e maltose foram maiores no mel cultivado em comparação ao mel natural. Em nossa recomendação, o mel natural é melhor que o mel de cultivo.

Studies on parasitic prevalence in pet birds from Punjab, Pakistan / Estudos de prevalência parasítica em pássaros de estimação de Punjab, Paquistão

During this one year study, blood and fecal samples of doves (Zenaida asiatica), ducks (Anas platyrhynchos), pigeons (Columba livia), partridges (Alectoris chukar), turkeys (Meleagris gallopavo) and goose (Chen caerulescens) were collected to assess the parasitic prevalence in these birds. The birds were kept at Avian Conservation and Research Center, Department of Wildlife and Ecology, University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore. All these avian species were kept in separate cages and their entire body was inspected on regularly basis to record external parasites. For internal parasites, 100 blood and 100 fecal samples for each species were analyzed. During present study, two species of ectoparasites i.e. fowl ticks (Args persicus) and mite (Dermanyssus gallinae) while 17 species of endoparasites; three from blood and 14 from fecal samples were identified. Prevalence of blood parasites was Plasmodium juxtanucleare 29.3%, Aegyptinella pullorum 15% and Leucoctoyzoon simond 13%. Parasitic species recorded from fecal samples included 6 species of nematodes viz. Syngamus trachea with parasitic prevalence of 50%, Capillaria anatis 40%, Capillaria annulata 37.5%, Heterakis gallinarum 28.3%, Ascardia galli 24% and Allodpa suctoria 2%. Similarly, two species of trematodes viz. Prosthogonimus ovatus having parasitic prevalence of 12.1% and Prosthogonimus macrorchis 9.1% were also recorded from fecal samples of the birds. Single cestode species Raillietina echinobothrida having parasitic prevalence of 27% and 3 protozoan species i.e. Eimeria maxima having prevalence 20.1%, Histomonas meleagridis 8% and Giardia lamblia 5.3% were recorded. In our recommendation, proper medication and sanitation of the bird's houses and cages is recommended to avoid parasites.

Durante este estudo de um ano, amostras de sangue e fezes de pombos (Zenaida asiatica), patos (Anas platyrhynchos), pombos (Columba livia), perdizes (Alectoris chukar), perus (Meleagris gallopavo) e ganso (Chen caerulescens) foram coletados para avaliar a prevalência de parasitas nessas aves. As aves foram mantidas no Centro de Conservação e Pesquisa de Aves, Departamento de Vida Selvagem e Ecologia, Universidade de Veterinária e Ciências Animais, Lahore. Todas essas espécies de aves foram mantidas em gaiolas separadas e todo o seu corpo foi inspecionado regularmente para registrar parasitas externos. Para parasitas internos, foram analisadas 100 amostras de sangue e 100 amostras fecais de cada espécie. Durante o presente estudo, duas espécies de ectoparasitas, ou seja, carrapatos de aves (Args persicus) e ácaros (Dermanyssus gallinae), enquanto 17 espécies de endoparasitas, três de sangue e 14 de amostras fecais, foram identificadas. Os parasitas sanguíneos prevalentes foram Plasmodium juxtanucleare, 29,3%, Aegyptinella pullorum, 15%, e Leucoctoyzoon simond, 13%. As espécies parasitas registradas em amostras fecais incluíram 6 espécies de nematoides viz. Syngamus traqueia com prevalência parasitária de 50%, Capillaria anatis, 40%, Capillaria annulata, 37,5%, Heterakis gallinarum, 28,3%, Ascardia galli, 24% e Allodpa suctoria, 2%. Da mesma forma, duas espécies de trematódeos viz. Prosthogonimus ovatus com prevalência parasitária de 12,1% e Prosthogonimus macrorchis, 9,1%, também foram registrados nas amostras fecais das aves. Espécies de cestoide único Raillietina echinobothrida com prevalência parasitária de 27% e 3 espécies de protozoários, ou seja, Eimeria maxima tendo prevalência de 20,1%, Histomonas meleagridis, 8%, e Giardia lamblia, 5,3%, foram registradas. Em nossa recomendação, são indicados medicação adequada e saneamento das casas e gaiolas dos pássaros para evitar parasitas.

Phylogeography of cliff racer (Platyceps rhodorachis Jan, 1865) from Punjab, Pakistan / Filografia de penhasco (Platyceps rhodorachis Jan, 1865) de Punjab, Paquistão

The present study reports the existence of cliff racer, Platyceps rhodorachis from the plains of Punjab, Pakistan. A total of 10 specimens were captured during the field surveys from June to September, 2018 from different sites of Punjab. Platyceps rhodorachis was identify on the basis of morphology and confirmed through COI gene sequences. The obtained DNA sequences have shown reliable and exact species identification. Newly produced DNA sequences of Platyceps rhodorachis were submitted to GenBank and accession numbers were obtained (MK936174.1, MK941839.1 and MT790210.1). N-J tree based on COI sequences of Platyceps rhodorachis clearly separated as out-group with other members of family Colubridae based on p-distance. The intra-specific genetic variation ranges from 12% to 18%. The DNA sequences of Platyceps rhodorachis kashmirensis, Platyceps rhodorachis ladacensis, Platyceps ventromaculatus, Platyceps ventromaculatus bengalensis and Platyceps ventromaculatus indusai are not available at NCBI to validate their taxonomic positions. In our recommendations, a large scale molecular based identification of Pakistan’s herpetofauna is required to report more new or subspecies from country.

O presente estudo relata a existência de um corredor de penhasco, Platyceps rhodorachis, das planícies de Punjab, Paquistão. Um total de 10 espécimes foi capturado durante os levantamentos de campo de junho a setembro de 2018 em diferentes locais de Punjab. Platyceps rhodorachis foi identificada com base na morfologia e confirmada por meio de sequências do gene COI. As sequências de DNA obtidas mostraram identificação de espécies confiável e exata. Sequências de DNA de Platyceps rhodorachis recém-produzidas foram submetidas ao GenBank e os números de acesso foram obtidos (MK936174.1, MK941839.1 e MT790210.1). Árvore N-J baseada em sequências COI de Platyceps rhodorachis claramente separadas como out-group com outros membros da família Colubridae com base na distância-p. A variação genética intraespecífica varia de 12% a 18%. As sequências de DNA de Platyceps rhodorachis kashmirensis, Platyceps rhodorachis ladacensis, Platyceps ventromaculatus, Platyceps ventromaculatus bengalensis e Platyceps ventromaculatus indusai não estão disponíveis no NCBI para validar suas posições taxonômicas. Em nossas recomendações, uma identificação de base molecular em grande escala da herpetofauna do Paquistão é necessária para relatar mais novas ou subespécies do país.

Cross-genera amplification and identification of Colpodella sp. with Cryptosporidium primers in fecal samples of zoo felids from northeast China / Amplificação cruzada de gêneros e identificação de Colpodella sp. com iniciadores de Cryptosporidium em amostras fecais de zoofilia do nordeste da China

The protozoans include many intracellular human pathogens. Accurate detection of these pathogens is necessary to treat the diseases. In clinical epidemiology, molecular identification of protozoan is considered a more reliable and rapid method for identification than microscopy. Among these protozoans, Cryptosporidium considered being one of the important water-borne zoonotic pathogens and a major cause of a diarrheal disease named cryptosporidiosis in humans, domestic animals, and wild animals. This study was aimed to identify Cryptosporidium in zoo felids (N= 56) belonging to different zoo of China, but accidentlly Colpodella was encountered in the zoo felids sample and phylogenetic data confirmed this unexpected amplification from fecal samples using two-step nested-PCR. Phylogenetic analysis revealed the fact about the specific primers used previously by many researchers and cross-genera amplification. We came to know that genetically sequenced amplicon gives more accurate identification of species. This study suggests more investigation on Colpodella which has been neglected previously but gains the attention of researchers after identified from humans and animals and has been known to correlate with neurological symptoms in patients.

Os protozoários incluem muitos patógenos humanos intracelulares. A detecção acurada desses patógenos é necessária para tratar as doenças. Na epidemiologia clínica, a identificação molecular de protozoários é considerada o método de identificação mais confiável e rápido do que a microscopia. Entre esses protozoários, o Cryptosporidium é considerado um dos importantes patógenos zoonóticos transmitidos pela água e uma das principais causas de uma doença diarreica denominada criptosporidiose em humanos, animais domésticos e selvagens. Este estudo teve como objetivo identificar Cryptosporidium em zoofelídeos (N = 56) pertencentes a diferentes zoológicos da China, mas acidentalmente Colpodella foi encontrada na amostra de zoofelídeos e os dados filogenéticos confirmaram essa amplificação inesperada de amostras fecais usando nested-PCR em duas etapas. A análise filogenética revelou o fato sobre os primers específicos usados anteriormente por muitos pesquisadores e a amplificação entre gêneros. Ficamos sabendo que o amplicon sequenciado geneticamente fornece uma identificação mais acurada das espécies. Este estudo sugere mais investigação sobre Colpodella, que foi negligenciada anteriormente, mas ganha a atenção dos pesquisadores depois de identificada em humanos e animais e é conhecida por se correlacionar com sintomas neurológicos em pacientes.

Variations in nutritional profile of honey produced by various species of genus Apis

Abstract The medicinal attributes of honey appears to overshadow its importance as a functional food. Consequently, several literatures are rife with ancient uses of honey as complementary and alternative medicine, with relevance to modern day health care, supported by evidence-based clinical data, with little attention given to honeys nutritional functions. The moisture contents of honey extracted from University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore honey bee farm was 12.19% while that of natural source was 9.03 ± 1.63%. Similarly, ash and protein contents of farmed honey recorded were 0.37% and 5.22%, respectively. Whereas ash and protein contents of natural honey were 1.70 ± 1.98% and 6.10 ± 0.79%. Likewise fat, dietary fiber and carbohydrates contents of farmed source documented were 0.14%, 1.99% and 62.26% respectively. Although fat, dietary fiber and carbohydrates contents of honey taken from natural resource were 0.54 ± 0.28%, 2.76 ± 1.07% and 55.32 ± 2.91% respectively. Glucose and fructose contents of honey taken out from honeybee farm were 27% and 34% but natural source were 22.50 ± 2.12% and 28.50 ± 3.54%. Glucose and fructose contents of honey taken out from honeybee farm were 27% and 34% but natural source were 22.50 ± 2.12% and 28.50 ± 3.54%. Similarly, sucrose and maltose contents of farmed honey were 2.5% and 12% while in natural honey were 1.35 ± 0.49% and 8.00 ± 1.41% respectively. The present study indicates that such as moisture, carbohydrates, sucrose and maltose contents were higher farmed honey as compared to the natural honey. In our recommendation natural honey is better than farmed honey.

Resumo Os atributos medicinais do mel parecem ofuscar sua importância como alimento funcional. Consequentemente, várias literaturas estão repletas de usos antigos do mel como medicina complementar e alternativa, com relevância para os cuidados de saúde modernos, apoiados por dados clínicos baseados em evidências, com pouca atenção dada às funções nutricionais do mel. O teor de umidade do mel extraído da Universidade de Veterinária e Ciências Animais, fazenda de abelhas de Lahore, foi de 12,19%, enquanto o de fonte natural foi de 9,03 ± 1,63%. Da mesma forma, os teores de cinzas e proteínas do mel cultivado foram de 0,37% e 5,22%, respectivamente. Já os teores de cinzas e proteínas do mel natural foram de 1,70 ± 1,98% e 6,10 ± 0,79%. Da mesma forma, os teores de gordura, fibra dietética e carboidratos de origem cultivada documentados foram de 0,14%, 1,99% e 62,26%, respectivamente. Embora os teores de gordura, fibra alimentar e carboidratos do mel retirado dos recursos naturais fossem de 0,54 ± 0,28%, 2,76 ± 1,07% e 55,32 ± 2,91%, respectivamente. Os conteúdos de glicose e frutose do mel retirado da fazenda de abelhas foram de 27% e 34%, mas a fonte natural foi de 22,50 ± 2,12% e 28,50 ± 3,54%. Os conteúdos de glicose e frutose do mel retirado da fazenda de abelhas foram de 27% e 34%, mas a fonte natural foi de 22,50 ± 2,12% e 28,50 ± 3,54%. Da mesma forma, os teores de sacarose e maltose no mel cultivado foram de 2,5% e 12%, enquanto no mel natural foram de 1,35 ± 0,49% e 8,00 ± 1,41%, respectivamente. O presente estudo indica que os teores de umidade, carboidratos, sacarose e maltose foram maiores no mel cultivado em comparação ao mel natural. Em nossa recomendação, o mel natural é melhor que o mel de cultivo.

Studies on parasitic prevalence in pet birds from Punjab, Pakistan

Abstract During this one year study, blood and fecal samples of doves (Zenaida asiatica), ducks (Anas platyrhynchos), pigeons (Columba livia), partridges (Alectoris chukar), turkeys (Meleagris gallopavo) and goose (Chen caerulescens) were collected to assess the parasitic prevalence in these birds. The birds were kept at Avian Conservation and Research Center, Department of Wildlife and Ecology, University of Veterinary and Animal Sciences, Lahore. All these avian species were kept in separate cages and their entire body was inspected on regularly basis to record external parasites. For internal parasites, 100 blood and 100 fecal samples for each species were analyzed. During present study, two species of ectoparasites i.e. fowl ticks (Args persicus) and mite (Dermanyssus gallinae) while 17 species of endoparasites; three from blood and 14 from fecal samples were identified. Prevalence of blood parasites was Plasmodium juxtanucleare 29.3%, Aegyptinella pullorum 15% and Leucoctoyzoon simond 13%. Parasitic species recorded from fecal samples included 6 species of nematodes viz. Syngamus trachea with parasitic prevalence of 50%, Capillaria anatis 40%, Capillaria annulata 37.5%, Heterakis gallinarum 28.3%, Ascardia galli 24% and Allodpa suctoria 2%. Similarly, two species of trematodes viz. Prosthogonimus ovatus having parasitic prevalence of 12.1% and Prosthogonimus macrorchis 9.1% were also recorded from fecal samples of the birds. Single cestode species Raillietina echinobothrida having parasitic prevalence of 27% and 3 protozoan species i.e. Eimeria maxima having prevalence 20.1%, Histomonas meleagridis 8% and Giardia lamblia 5.3% were recorded. In our recommendation, proper medication and sanitation of the birds houses and cages is recommended to avoid parasites.

Resumo Durante este estudo de um ano, amostras de sangue e fezes de pombos (Zenaida asiatica), patos (Anas platyrhynchos), pombos (Columba livia), perdizes (Alectoris chukar), perus (Meleagris gallopavo) e ganso (Chen caerulescens) foram coletados para avaliar a prevalência de parasitas nessas aves. As aves foram mantidas no Centro de Conservação e Pesquisa de Aves, Departamento de Vida Selvagem e Ecologia, Universidade de Veterinária e Ciências Animais, Lahore. Todas essas espécies de aves foram mantidas em gaiolas separadas e todo o seu corpo foi inspecionado regularmente para registrar parasitas externos. Para parasitas internos, foram analisadas 100 amostras de sangue e 100 amostras fecais de cada espécie. Durante o presente estudo, duas espécies de ectoparasitas, ou seja, carrapatos de aves (Args persicus) e ácaros (Dermanyssus gallinae), enquanto 17 espécies de endoparasitas, três de sangue e 14 de amostras fecais, foram identificadas. Os parasitas sanguíneos prevalentes foram Plasmodium juxtanucleare, 29,3%, Aegyptinella pullorum, 15%, e Leucoctoyzoon simond, 13%. As espécies parasitas registradas em amostras fecais incluíram 6 espécies de nematoides viz. Syngamus traqueia com prevalência parasitária de 50%, Capillaria anatis, 40%, Capillaria annulata, 37,5%, Heterakis gallinarum, 28,3%, Ascardia galli, 24% e Allodpa suctoria, 2%. Da mesma forma, duas espécies de trematódeos viz. Prosthogonimus ovatus com prevalência parasitária de 12,1% e Prosthogonimus macrorchis, 9,1%, também foram registrados nas amostras fecais das aves. Espécies de cestoide único Raillietina echinobothrida com prevalência parasitária de 27% e 3 espécies de protozoários, ou seja, Eimeria maxima tendo prevalência de 20,1%, Histomonas meleagridis, 8%, e Giardia lamblia, 5,3%, foram registradas. Em nossa recomendação, são indicados medicação adequada e saneamento das casas e gaiolas dos pássaros para evitar parasitas.

Phylogeography of cliff racer (Platyceps rhodorachis Jan, 1865) from Punjab, Pakistan

Abstract The present study reports the existence of cliff racer, Platyceps rhodorachis from the plains of Punjab, Pakistan. A total of 10 specimens were captured during the field surveys from June to September, 2018 from different sites of Punjab. Platyceps rhodorachis was identify on the basis of morphology and confirmed through COI gene sequences. The obtained DNA sequences have shown reliable and exact species identification. Newly produced DNA sequences of Platyceps rhodorachis were submitted to GenBank and accession numbers were obtained (MK936174.1, MK941839.1 and MT790210.1). N-J tree based on COI sequences of Platyceps rhodorachis clearly separated as out-group with other members of family Colubridae based on p-distance. The intra-specific genetic variation ranges from 12% to 18%. The DNA sequences of Platyceps rhodorachis kashmirensis, Platyceps rhodorachis ladacensis, Platyceps ventromaculatus, Platyceps ventromaculatus bengalensis and Platyceps ventromaculatus indusai are not available at NCBI to validate their taxonomic positions. In our recommendations, a large scale molecular based identification of Pakistans herpetofauna is required to report more new or subspecies from country.

Resumo O presente estudo relata a existência de um corredor de penhasco, Platyceps rhodorachis, das planícies de Punjab, Paquistão. Um total de 10 espécimes foi capturado durante os levantamentos de campo de junho a setembro de 2018 em diferentes locais de Punjab. Platyceps rhodorachis foi identificada com base na morfologia e confirmada por meio de sequências do gene COI. As sequências de DNA obtidas mostraram identificação de espécies confiável e exata. Sequências de DNA de Platyceps rhodorachis recém-produzidas foram submetidas ao GenBank e os números de acesso foram obtidos (MK936174.1, MK941839.1 e MT790210.1). Árvore N-J baseada em sequências COI de Platyceps rhodorachis claramente separadas como out-group com outros membros da família Colubridae com base na distância-p. A variação genética intraespecífica varia de 12% a 18%. As sequências de DNA de Platyceps rhodorachis kashmirensis, Platyceps rhodorachis ladacensis, Platyceps ventromaculatus, Platyceps ventromaculatus bengalensis e Platyceps ventromaculatus indusai não estão disponíveis no NCBI para validar suas posições taxonômicas. Em nossas recomendações, uma identificação de base molecular em grande escala da herpetofauna do Paquistão é necessária para relatar mais novas ou subespécies do país.

Cross-genera amplification and identification of Colpodella sp. with Cryptosporidium primers in fecal samples of zoo felids from northeast China

Abstract The protozoans include many intracellular human pathogens. Accurate detection of these pathogens is necessary to treat the diseases. In clinical epidemiology, molecular identification of protozoan is considered a more reliable and rapid method for identification than microscopy. Among these protozoans, Cryptosporidium considered being one of the important water-borne zoonotic pathogens and a major cause of a diarrheal disease named cryptosporidiosis in humans, domestic animals, and wild animals. This study was aimed to identify Cryptosporidium in zoo felids (N= 56) belonging to different zoo of China, but accidentlly Colpodella was encountered in the zoo felids sample and phylogenetic data confirmed this unexpected amplification from fecal samples using two-step nested-PCR. Phylogenetic analysis revealed the fact about the specific primers used previously by many researchers and cross-genera amplification. We came to know that genetically sequenced amplicon gives more accurate identification of species. This study suggests more investigation on Colpodella which has been neglected previously but gains the attention of researchers after identified from humans and animals and has been known to correlate with neurological symptoms in patients.

Resumo Os protozoários incluem muitos patógenos humanos intracelulares. A detecção acurada desses patógenos é necessária para tratar as doenças. Na epidemiologia clínica, a identificação molecular de protozoários é considerada o método de identificação mais confiável e rápido do que a microscopia. Entre esses protozoários, o Cryptosporidium é considerado um dos importantes patógenos zoonóticos transmitidos pela água e uma das principais causas de uma doença diarreica denominada criptosporidiose em humanos, animais domésticos e selvagens. Este estudo teve como objetivo identificar Cryptosporidium em zoofelídeos (N = 56) pertencentes a diferentes zoológicos da China, mas acidentalmente Colpodella foi encontrada na amostra de zoofelídeos e os dados filogenéticos confirmaram essa amplificação inesperada de amostras fecais usando nested-PCR em duas etapas. A análise filogenética revelou o fato sobre os primers específicos usados anteriormente por muitos pesquisadores e a amplificação entre gêneros. Ficamos sabendo que o amplicon sequenciado geneticamente fornece uma identificação mais acurada das espécies. Este estudo sugere mais investigação sobre Colpodella, que foi negligenciada anteriormente, mas ganha a atenção dos pesquisadores depois de identificada em humanos e animais e é conhecida por se correlacionar com sintomas neurológicos em pacientes.

Prevalence of cestodes infection among school children of urban parts of Lower Dir district, Pakistan / Prevalência de infecção de cestóides entre crianças em idade escolar de partes urbanas do distrito de Lower Dir, Paquistão

Tapeworms of zoonotic importance have been described as a leading public health problem. Current research was aim to assess the prevalence of tapeworms among 5-12years school children residing in district Lower Dir, Pakistan from January 2019-December 2019. The wet mount preparation in saline/iodine/methods were used for stool examination. Data was analyzed using appropriate descriptive, static methods. Of the 400 children studied 71.7% were infected with one or more species of intestinal parasites. Single infection of cestode species was found in 69 individuals with 17.2% prevalence and multiple parasitic infections were identified in 19.7% (n=79/400) individuals. The multiple infection were comprised as 10% (n=40) double, 6.75% (n=27) triple and 3% (n=12) quadruple. A total of 9 species of helminths and one species of protozoan infection. Among the helminths Ascaris lumbricoides was the most prevalent 33.1% (n=95), Taenia saginata 22.6% (n=65), hookworm 19.8% (n=57), Hymenolepis nana 18.8% (n=54), Enterobius vermicularis and Hymenolepis diminuta 1.39% (n=4each), Trichuris trichura 1.04% (n=3), Toxocara spp 0.69% (n=2) and Schistosoma japonicum 0.34% (n=1) were reported. One protozoan species was Cryptosporidium spp 0.69% (n=2) in current study. In case of A.lumbricoides, hookworm, E.vermicularis, T.trichura, T.saginata, H.nana and H.diminuta the male children of below 8 years of age were highly infected. Other infections are reported in the same prevalence with slight difference if any. We conclude that there is a need for mass scale campaigns to create awareness regarding health and hygiene in children and the need for development of effective poverty control programs because deworming alone is not adequate to control parasitic infections.

As tênias de importância zoonótica têm sido descritas como um dos principais problemas de saúde pública. A pesquisa atual teve como objetivo avaliar a prevalência de tênias entre crianças em idade escolar de 5 a 12 anos que residem no distrito de Lower Dir, Paquistão, de janeiro de 2019 a dezembro de 2019. Os métodos de preparação para montagem úmida em solução salina/iodo foram usados para exame de fezes. Os dados foram analisados usando métodos descritivos e estáticos apropriados. Das 400 crianças estudadas, 71,7% estavam infectadas com uma ou mais espécies de parasitas intestinais. Infecção única de espécies de cestóides foi encontrada em 69 indivíduos com prevalência de 17,2% e infecções parasitárias múltiplas foram identificadas em 19,7% (n = 79/400) indivíduos. As infecções múltiplas foram compostas por 10% (n = 40) dupla, 6,75% (n = 27) tripla e 3% (n = 12) quádrupla. Um total de 9 espécies de helmintos e uma espécie de infecção por protozoários. Entre os helmintos, Ascaris lumbricoides foi o mais prevalente 33,1% (n = 95), Taenia saginata 22,6% (n = 65), ancilóstomo 19,8% (n = 57), Hymenolepis nana 18,8% (n = 54), Enterobius vermicularis e Hymenolepis diminuta 1,39% (n = 4cada), Trichuris trichura 1,04% (n = 3), Toxocara spp 0,69% (n = 2) e Schistosoma japonicum 0,34% (n = 1). Uma espécie de protozoário foi Cryptosporidium spp 0,69% (n = 2) no estudo atual. No caso de A.lumbricoides, ancilostomíase, E.vermicularis, T.trichura, T.saginata, H.nana e H.diminuta, as crianças do sexo masculino com menos de 8 anos de idade estavam altamente infectadas. Outras infecções são relatadas na mesma prevalência, com ligeira diferença, se houver. Concluímos que há uma necessidade de campanhas em massa para criar consciência sobre saúde e higiene em crianças e a necessidade de desenvolvimento de programas eficazes de controle da pobreza, porque a desparasitação por si só não é adequada para controlar infecções parasitárias.

Prevalence of cestodes infection among school children of urban parts of Lower Dir district, Pakistan / Prevalência de infecção de cestóides entre crianças em idade escolar de partes urbanas do distrito de Lower Dir, Paquistão

Tapeworms of zoonotic importance have been described as a leading public health problem. Current research was aim to assess the prevalence of tapeworms among 5-12years school children residing in district Lower Dir, Pakistan from January 2019-December 2019. The wet mount preparation in saline/iodine/methods were used for stool examination. Data was analyzed using appropriate descriptive, static methods. Of the 400 children studied 71.7% were infected with one or more species of intestinal parasites. Single infection of cestode species was found in 69 individuals with 17.2% prevalence and multiple parasitic infections were identified in 19.7% (n=79/400) individuals. The multiple infection were comprised as 10% (n=40) double, 6.75% (n=27) triple and 3% (n=12) quadruple. A total of 9 species of helminths and one species of protozoan infection. Among the helminths Ascaris lumbricoides was the most prevalent 33.1% (n=95), Taenia saginata 22.6% (n=65), hookworm 19.8% (n=57), Hymenolepis nana 18.8% (n=54), Enterobius vermicularis and Hymenolepis diminuta 1.39% (n=4each), Trichuris trichura 1.04% (n=3), Toxocara spp 0.69% (n=2) and Schistosoma japonicum 0.34% (n=1) were reported. One protozoan species was Cryptosporidium spp 0.69% (n=2) in current study. In case of A.lumbricoides, hookworm, E.vermicularis, T.trichura, T.saginata, H.nana and H.diminuta the male children of below 8 years of age were highly infected. Other infections are reported in the same prevalence with slight difference if any. We conclude that there is a need for mass scale campaigns to create awareness regarding health and hygiene in children and the need for development of effective poverty control programs because deworming alone is not adequate to control parasitic infections.

As tênias de importância zoonótica têm sido descritas como um dos principais problemas de saúde pública. A pesquisa atual teve como objetivo avaliar a prevalência de tênias entre crianças em idade escolar de 5 a 12 anos que residem no distrito de Lower Dir, Paquistão, de janeiro de 2019 a dezembro de 2019. Os métodos de preparação para montagem úmida em solução salina/iodo foram usados para exame de fezes. Os dados foram analisados usando métodos descritivos e estáticos apropriados. Das 400 crianças estudadas, 71,7% estavam infectadas com uma ou mais espécies de parasitas intestinais. Infecção única de espécies de cestóides foi encontrada em 69 indivíduos com prevalência de 17,2% e infecções parasitárias múltiplas foram identificadas em 19,7% (n = 79/400) indivíduos. As infecções múltiplas foram compostas por 10% (n = 40) dupla, 6,75% (n = 27) tripla e 3% (n = 12) quádrupla. Um total de 9 espécies de helmintos e uma espécie de infecção por protozoários. Entre os helmintos, Ascaris lumbricoides foi o mais prevalente 33,1% (n = 95), Taenia saginata 22,6% (n = 65), ancilóstomo 19,8% (n = 57), Hymenolepis nana 18,8% (n = 54), Enterobius vermicularis e Hymenolepis diminuta 1,39% (n = 4cada), Trichuris trichura 1,04% (n = 3), Toxocara spp 0,69% (n = 2) e Schistosoma japonicum 0,34% (n = 1). Uma espécie de protozoário foi Cryptosporidium spp 0,69% (n = 2) no estudo atual. No caso de A. lumbricoides, ancilostomíase, E. vermicularis, T. trichura, T. saginata, H. nana e H. diminuta, as crianças do sexo masculino com menos de 8 anos de idade estavam altamente infectadas. Outras infecções são relatadas na mesma prevalência, com ligeira diferença, se houver. Concluímos que há uma necessidade de campanhas em massa para criar consciência sobre saúde e higiene em crianças e a necessidade de desenvolvimento de programas eficazes de controle da pobreza, porque a desparasitação por si só não é adequada para controlar infecções parasitárias.

Prevalence of cestodes infection among school children of urban parts of Lower Dir district, Pakistan

Abstract Tapeworms of zoonotic importance have been described as a leading public health problem. Current research was aim to assess the prevalence of tapeworms among 5-12years school children residing in district Lower Dir, Pakistan from January 2019-December 2019. The wet mount preparation in saline/iodine/methods were used for stool examination. Data was analyzed using appropriate descriptive, static methods. Of the 400 children studied 71.7% were infected with one or more species of intestinal parasites. Single infection of cestode species was found in 69 individuals with 17.2% prevalence and multiple parasitic infections were identified in 19.7% (n=79/400) individuals. The multiple infection were comprised as 10% (n=40) double, 6.75% (n=27) triple and 3% (n=12) quadruple. A total of 9 species of helminths and one species of protozoan infection. Among the helminths Ascaris lumbricoides was the most prevalent 33.1% (n=95), Taenia saginata 22.6% (n=65), hookworm 19.8% (n=57), Hymenolepis nana 18.8% (n=54), Enterobius vermicularis and Hymenolepis diminuta 1.39% (n=4each), Trichuris trichura 1.04% (n=3), Toxocara spp 0.69% (n=2) and Schistosoma japonicum 0.34% (n=1) were reported. One protozoan species was Cryptosporidium spp 0.69% (n=2) in current study. In case of A.lumbricoides, hookworm, E.vermicularis, T.trichura, T.saginata, H.nana and H.diminuta the male children of below 8 years of age were highly infected. Other infections are reported in the same prevalence with slight difference if any. We conclude that there is a need for mass scale campaigns to create awareness regarding health and hygiene in children and the need for development of effective poverty control programs because deworming alone is not adequate to control parasitic infections.

Resumo As tênias de importância zoonótica têm sido descritas como um dos principais problemas de saúde pública. A pesquisa atual teve como objetivo avaliar a prevalência de tênias entre crianças em idade escolar de 5 a 12 anos que residem no distrito de Lower Dir, Paquistão, de janeiro de 2019 a dezembro de 2019. Os métodos de preparação para montagem úmida em solução salina/iodo foram usados para exame de fezes. Os dados foram analisados usando métodos descritivos e estáticos apropriados. Das 400 crianças estudadas, 71,7% estavam infectadas com uma ou mais espécies de parasitas intestinais. Infecção única de espécies de cestóides foi encontrada em 69 indivíduos com prevalência de 17,2% e infecções parasitárias múltiplas foram identificadas em 19,7% (n = 79/400) indivíduos. As infecções múltiplas foram compostas por 10% (n = 40) dupla, 6,75% (n = 27) tripla e 3% (n = 12) quádrupla. Um total de 9 espécies de helmintos e uma espécie de infecção por protozoários. Entre os helmintos, Ascaris lumbricoides foi o mais prevalente 33,1% (n = 95), Taenia saginata 22,6% (n = 65), ancilóstomo 19,8% (n = 57), Hymenolepis nana 18,8% (n = 54), Enterobius vermicularis e Hymenolepis diminuta 1,39% (n = 4cada), Trichuris trichura 1,04% (n = 3), Toxocara spp 0,69% (n = 2) e Schistosoma japonicum 0,34% (n = 1). Uma espécie de protozoário foi Cryptosporidium spp 0,69% (n = 2) no estudo atual. No caso de A.lumbricoides, ancilostomíase, E.vermicularis, T.trichura, T.saginata, H.nana e H.diminuta, as crianças do sexo masculino com menos de 8 anos de idade estavam altamente infectadas. Outras infecções são relatadas na mesma prevalência, com ligeira diferença, se houver. Concluímos que há uma necessidade de campanhas em massa para criar consciência sobre saúde e higiene em crianças e a necessidade de desenvolvimento de programas eficazes de controle da pobreza, porque a desparasitação por si só não é adequada para controlar infecções parasitárias.

Development patterns of necrophagous flies infesting rabbit carcasses decomposing in Mount Kapur Cave and its surrounding primary forest in Kuching, Sarawak

@#In addition to the scarcity of forensic entomology baseline data on oviposition of necrophagous insects and completion of their life cycles in the Borneo region, similar data derived from caves remain unreported. Since entomological baseline data can differ from one biogeoclimatic region to another, the lack of such data would limit the practical values of applying entomological evidence in estimating minimum postmortem interval (mPMI). Therefore, this present research that investigated oviposition and completion of life cycles of necrophagous flies infesting rabbit carcasses decomposing in Mount Kapur Cave and its surrounding forest habitat in Kuching, Sarawak merits forensic consideration. In general, 13 taxa of necrophagous flies were identified viz. Hypopygiopsis violacea, Hypopygiopsis fumipennis, Hemipyrellia ligurriens, Hemipyrellia tagaliana, Chrysomya megacephala, Chrysomya villeneuvi, Chrysomya rufifacies, Chrysomya chani, Chrysomya pinguis, Chrysomya nigripes, Ophyra spinigera and Ophyra chalcogaster, as well as unidentified Sarcophagidae. In addition, Hyp. violacea and Hyp. fumipennis were the two earlier necrophagous flies that oviposited in all rabbit carcasses decomposing in both habitats. While all these necrophagous flies were observed infesting carcasses in Mount Kapur Cave, Hem. ligurriens and Hem. tagaliana were not found infesting carcasses in the surrounding forest habitat. Complete life cycles for six and five different necrophagous fly species were successfully observed in Mount Kapur Cave and its surrounding forest habitat, respectively. Significant delay in oviposition, as well as longer durations for completing the life cycles in several necrophagous fly species were observed in Mount Kapur Cave when compared with those of surrounding forest habitat (p < 0.05). These findings deserve consideration as the first ever forensic empirical baseline data on oviposition and completion of life cycles for necrophagous flies in Sarawak as well as in a cave habitat, in view of its practical values for estimating mPMI for forensic practical caseworks.

Molecular genetic diagnosis of beta thalassemia in Pakistan

A set of procedures, based on DNA analysis, has been developed to detect deletions and point mutations causing Beta thalassemia in the Pakistani population. These procedures can be used to analyze the presence of relevant changes in DNA, thus providing a reliable means for screening the high risk families, to provide them genetic counseling and prenatal diagnosis during early pregnancy. We have identified two mutations IVS-1 nt.5 [G--C] and codon 8-9 [+G] in 4 of the 6 families analysed for these mutations